Обработка неправильно отрабатывает транзакцию "сторно" (тип 12).
Если внимательно посмотрите, то после каждой из упомянутых регистраций (тип транзакции 11) есть транзакция с типом 12.
В ДЭНСИ: КАССе транзакция 12 означает, что именно эта (а не предыдущая) позиция была зарегистрирована в чеке, а затем сторнирована.
Т.е. в обработке надо просто закомментировать кусок кода, обрабатывающий транзакцию 12 ("сторно")
P.S.
diman123 писал(а):данный вид товара не выгружается в 1с, но при этом присутствует в report.txt
Долго думал, что это вообще означает

Было бы понятнее, если сказать, что товар не загружается в 1С, хотя присутствует в файле отчета report.txt (т.е. выгружается-таки из ДЭНСИ: КАССы)